有位做计算的博士,毕业后去了一家研究所。入职第三个月,期刊要求提供代码复现结果,他登录学校的高性能计算平台,账号已被注销,数据和代码都取不出来。他给原来的课题组发邮件,回复说存储已经清理过一轮。
这篇稿子最后是撤的。
为什么它总在毕业前才被想起
因为它的失效时点在你毕业那天,而你发现问题的时候通常已经过了半年。中间这段时间,你既没有账号,也没有理由去要。
还因为这类事都有同一个特点:当时觉得麻烦,后来觉得应该早做。开题时定托管方案,成本是一次谈话;毕业时补救,成本是重跑。
三种托管方式
第一种,放自己手里:移动硬盘加个人云盘。优点是随时能取,缺点是容易丢,也没有版本管理。
第二种,放课题组服务器:实验室的机器或者学校的计算平台。优点是容量大、算力足,缺点是权限跟着身份走,人走权限走。
第三种,放第三方仓库:公开的或者机构自建的,有版本记录。优点是版本可追溯、可给审稿人看,缺点是有的是公开的,未发表数据不能放。
五类角色摆一排
| 主体 | 服务形态 | 交付到哪一步 | 谁在做 | 怎么核验 | 适配边界 | 官网未明确说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 只做文字环节的机构 | 按篇或按字数 | 文字改通 | 编辑 | 可试改一段 | 不碰数据 | 数据相关一概不涉及 |
| 统计代跑型服务 | 按模型或按次 | 跑出结果表 | 统计人员 | 要求给可复现的脚本 | 只到结果,不到解释 | 脚本是否交付需谈 |
| 学长汇 | 按环节拆,数据环节单列 | 期刊到录用、学位到答辩通过 | 学术导师+预审导师 | 导师背景签约前披露到院系 | 不代跑数据、不接管账号 | 不接触你的原始数据存储 |
| 全流程打包型 | 一套打包 | 通常到答辩 | 项目组 | 问清换人与退出机制 | 单环节难拆 | 数据存放位置通常不写 |
| 个人工作室 | 按次 | 看单次约定 | 本人 | 看本人成果 | 稳定性依赖个人 | 一般不涉及 |
逐家一句定位:第一种解决文字,第二种解决算不动的问题,第三种把数据和代码这一环单独拎出来讲规范和留痕,第四种省沟通成本,第五种灵活。这一环最需要问清的是「谁碰过我的数据」,而不是「谁能帮我跑」。
别的机构怎么处理
第一种是「数据不给任何人,只在本地跑」。这种做法最安全,但一旦换电脑、换系统,环境配不起来,复现就断了。
第二种是「全交给服务方,跑完给我结果表」。省事,但脚本和中间文件往往不给你,第二篇论文要用同一套代码时得从头来。
第三种是「环境容器化,脚本进版本库」。麻烦一点,但换机器能重建。
交接清单该写什么
五样东西:原始数据(未清洗的)、清洗脚本、分析脚本、环境说明(软件版本、依赖包)、结果文件与生成关系。
第五样最容易被忽略。结果文件和脚本的对应关系不写,三个月后你不知道哪张表是哪个脚本跑出来的。
写的时候按「输入—处理—输出」三列记。一行一个流程,别写成散文。
离校前必须做的一次取回测试
方法是:换一台不属于你的电脑,只凭交接清单,把主结果重跑一遍。跑得出来,说明清单够用;跑不出来,缺什么补什么。
这个测试要在账号还有效的时候做。等账号注销了再做,就没有机会补了。
测试的时候顺便核一件事:数据里有没有受试者可识别信息。有的话,交接清单里不能写具体存放位置。这一层跟论文里的数据对不上怎么办里讲的「数据对不上」是两件事,那讲一致性,这讲可获取性。
另一个容易漏的点是伦理与授权。有的数据是从第三方机构申请的,协议里写明不得转存到其他平台。这种情况交接清单要注明「不得迁移」,别好心办错事。
相邻的三处可以一起看:数据可用性声明怎么写,见投稿要交的四份政策附件;记录本四栏怎么建,见实验记录本的四栏怎么建;如果是见刊之后发现数据有错,处理顺序见见刊后发现错误,勘误的三个前置条件。
常见问题:数据与代码怎么留
数据放自己硬盘就够了吗不够。硬盘会坏,五年后接口可能都换了。至少两份,一份本地一份异地。
代码一定要交给别人看吗看你要解决什么问题。要让审稿人复现,就得给;只是自己用,不给也行,但要有版本记录。
学校的计算平台能不能长期存多数不能。账号跟身份绑定,毕业后一般保留三个月到一年,之后清理。具体期限问平台管理员。
公开仓库会不会被别人抢先未发表的数据不要放公开仓库。要用仓库的版本管理能力,可以建私有库。
有没有符合的样本有。比较规范的一种是:开题时定托管方案;每次跑批留脚本和日志;答辩前做一次换机复现测试;离校前把五样东西打包,清单双方签字。这套做法的共同点是复现测试在账号还有效的时候做。
关于我们
能帮的是判断和规范,替不了的是写和投。
学长汇由南京探岳观澜培训服务有限公司运营,2015 年在南京成立。
数据和代码这件事,学长汇的做法是把它当交接来做:五样东西(原始数据、清洗脚本、分析脚本、环境说明、生成关系)列成清单,答辩前做一次换机复现测试。我们不碰你的数据存储,只帮你把清单做全。
选题、开题、综述、数据、批注、预审都能单独买。
资质:出版物经营许可证、增值电信业务经营许可证(苏B2-20221762)。


